Rui Vieira da Cunha licenciou‑se em Direito (2003) e exerceu advocacia por cinco anos, antes de concluir a licenciatura em Filosofia (2008). Tem uma pós‑graduação em Medicina Legal (2004) e outra em Ensino (2009).
É membro do MLAG (Grupo de Mente, Linguagem e Acção) do Instituto de Filosofia da Faculdade de Letras da Universidade do Porto e está a realizar aí o seu doutoramento, sobre o conceito de pessoa e o problema da identidade pessoal, tendo publicado sobre essas e outras questões relacionadas, que constituem o essencial da área de especialização da sua tese. Os seus principais interesses de investigação encontram‑se na intersecção da filosofia e do direito (livre arbítrio, dignidade humana, melhoramento humano, finalidades das penas, etc.).
De 2013 a 2016, integrou a Unidade de Comunicação Científica do IBMC (Instituto de Biologia Molecular e Celular), agora i3s (Instituto de Investigação e Inovação em Saúde), ao abrigo do projecto europeu NERRI (Neuro‑Enhancement Responsible Research and Innovation). Desde 2019 faz parte da Comissão de Ética do i3s (Instituto de Investigação e Inovação em Saúde).
É ainda docente na Business School da Universidade Católica do Porto (nomeadamente das disciplinas de 1.º ciclo de Filosofia Social e Ética; Cristianismo, Culturas e Organizações; e Projeto Multidisciplinar, focado em argumentação e lógica informal) e membro do ARGH (Argumentation Hub), nos Media Innovation Labs da Universidade do Porto.